RoGenoFil SARS-CoV-2

Obiective propuse

Obiectivul general al proiectului este de a elabora tehnici de monitorizare a patogenității tulpinilor circulante in diferite regiuni geografice din Romania, în relație cu exprimarea fenotipica a infecției la persoanele SARS-CoV2 pozitive și a potențialului de adaptare la organismele umane, bazate pe secvențierea genomului SARS-CoV-2. Acest obiectiv general se va realiza prin indeplinirea urmatoarelor obiective specifice:

• 1. Pre-testarea și ajustarea metodologiei și validare a metodologiei de colectare și analiză a datelor și probelor biologice;
• 2. Identificarea variantelor genomice și analiza filogenetică a tulpinilor SARS-CoV-2 circulante în Romania, prin intermediul secvențierii probelor recoltate de la pacienți infectați cu forme severe, medii, usoare și asimptomatici, proveniți din regiunile geografice reprezentative ale Romaniei, folosind tehnologii de noua generatie de secventiere (NGS);
• 3. Analiza genomice comparative intre diferite tehnologii de secventiere pentru SARS-CoV-2;
• 4. Cartarea izolatelor virale si a mutațiilor genetice identificate in variantele genomice ale SARS-CoV-2, caracterizate de la pacienți infectați din diferite regiunile geografice ale României, în vederea stabilirii filiației cazurilor;
• 5. Evaluarea relației predictive sau a asocierii dintre prezența unor posibili factori de risc specifici populației României (patogenetici, socio-demografici, de mediu, etc.) sau dintre modificările de compoziție genomică a SARS-CoV-2 in rândul esantionului colectat și spectrul evoluției clinice a pacientilor (formele de boala si severitatea acestora);
• 6. Estimarea numărului total de persoane infectate la nivel national, modeland traseul și viteza raspandirii comunitare a SARS-CoV-2;
• 7. Stocarea informațiilor rezultate din asamblarea, adnotarea și compararea secventelor genomice ale SARS-CoV-2 izolate din Romania, în baze de date publice de biologie moleculară.